PacBio le retour : Sequel II, les premiers résultats prometteurs !
Arrivé juste avant le confinement, le Sequel II de Pacific BioSciences a pu enfin être validé et pris en main par l’équipe GeT-PlaGe. Nous vous invitons à voir les applications et caractéristiques sur sa page dédiée.
La majorité des runs effectués ont été faits avec le mode HIFI. Il est utile pour le séquençage de novo ainsi que pour la détection des différents types de variants (SNPs, indels, variants structuraux) et ce, grâce à des reads de haute fiabilité.
Pour plus de détails, n’hésitez pas à parcourir la présentation de PacBio (Déborah Moine) faite le 1er Octobre sur le site de l’INRAe d’Occitanie Toulouse.
Depuis la formation en Mars,
- 26 SMRTcells HIFI ont été séquencées : entre 16Gb et 31Gb de données CCS (Q20) avec une moyenne de 23Gb produites pour des librairies de 15kb.
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A très vite pour de nouveaux résultats et de nouveaux projets exaltants !