GeT | GeT-PlaGe
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
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GeT-PlaGe

Responsable opérationnel

Description / spécificités

  • Mise à disposition de matériels et compétence pour le génotypage , le séquençage sur séquenceurs capillaires et nouvelle génération (NGS), la qPCR.
  • Implication dans la définition, la mise en œuvre et la réalisation de projets (ANR, Européens…).
  • Plateforme ISO9001 et NFX50-900, relabellisée IBiSA en 2008, plateforme stratégique INRA depuis 2008 et plateforme Investissement d’Avenir France Génomique.

Outils

Equipement

  • Matériel phare :
    • 1 PromethIon (Oxford Nanopore Technologies)
    • 1 GridIon (Oxford Nanopore Technologies)
    • 1 NovaSeq (Illumina)
    • 1 HiSeq3000 (Illumina)
    • 4 MiSeq (Illumina)
    • Chromium (10x Genomics)
    • BioMark (Fluidigm)
  • Liste exhaustive des équipements accessibles sur GeT-PlaGe après formation, ou par la réalisation de votre projet par l’équipe GeT-PlaGe.

Perspectives

  • Oxford Nanopore Technologies
    • PromethION en cours de validation via des collaborations scientifiques
  • Illumina HiSeq :
    • Génotypage par séquençage, après Access Array
    • Capture
  • Le projet SeqOccIn (2019-21), financé par le FEDER et un consortium de partenaires privés, et visant à l’acquisition d’expertise dans l’utilisation des séquenceurs Long Reads sur molécules uniques, est aussi l’occasion de focaliser des moyens importants sur la R&D. Il ouvre des perspectives importantes pour la plateforme

Accès

  • public/privé.
  • Projets moyen/haut débit sur toutes espèces.

Qualité

CONTACT

GeT-PlaGe (Plateforme Génomique)
Campus INRA
24 chemin de borde rouge – Auzeville
CS 52627
31326 CASTANET-TOLOSAN Cedex
Fax : 05 61 28 55 93
get-plage@genotoul.fr

Situation géographique

Quelques indications pour venir en fonction de votre moyen de transport ici .