Long reads : Acquisition du Chromium de 10X Genomics
Cette machine permet de générer des long reads à partir de données générées en Illumina.
Le Chromium controller de 10X Genomics est arrivé à GeT-PlaGe! Cette nouvelle technologie devrait nous permettre de faire des assemblages de short-reads Illumina via un système de barcoding unique, rendant accessibles des informations à longue distance, permettant l’analyse de variants, de phasing et de la caractérisation de structures génomiques. Elle permet également d’étudier le transcriptome par RNAseq de plusieurs milliers de cellules uniques en parallèle. Le training est prévu pour la mi-novembre sur GeT-PlaGe.