Les Aviti sont arrivées : la nouvelle génération en séquençage short reads.
Vos problématiques de Recherche sont au cœur de notre démarche d’innovation. Dans le but de toujours vous conseiller les applications les mieux adaptées à votre projet Scientifique, GeT-PlaGe a le plaisir de vous annoncer l’intégration de la technologie Short Read AVITI d’Element Biosciences. Cette acquisition est financée grâce au CPER 2021-2027.
Cette nouvelle génération de séquenceurs vient remplacer les systèmes NovaSeq et MiSeq actuellement utilisés, afin d’optimiser les performances, la rapidité et la flexibilité des analyses génétiques.
Les séquenceurs AVITI d’Element Biosciences offrent une technologie innovante, permettant un séquençage plus rapide, plus précis et plus économique. Grâce à elle, Get-PlaGe renforce sa capacité à vous fournir des services de séquençage de haute qualité.
Depuis septembre 2024, trois séquenceurs AVITI baptisés ADA, ROSALIND et MARIE (en référence à 3 grandes scientifiques) ont été installés.
Nous avons réalisé de nombreux tests de validation et de comparaison avec nos technologies déjà en place. Ces résultats montrent des qualités équivalentes voire meilleures que sur la génération précédente, ce qui nous conforte dans notre choix.
Vous trouverez ci-dessous quelques exemples de ces tests :
DNAseq : Pourcentage d’alignement, taux d’erreur et pourcentage de duplicat à partir de librairies TruSeq DNA Nano.
Ces résultats montrent un pourcentage d’alignement et un taux d’erreur identique entre NovaSeq et Aviti. Le pourcentage de duplicat est quant à lui plus faible sur Aviti.
Métagénomique : Analyses de diversité à partir de librairies Amplicons (16s V3V4)
Ces tests montrent des résultats de diversité similaires entre MiSeq et Aviti.
Retrouvez toutes les informations techniques dans la fiche dédiée Aviti.
N’hésitez pas nous contacter (get-plage.contact@genotoul.fr) pour plus d’informations au sujet des Aviti ou pour discuter de vos projets.