Le 21 juin à 16H, salle de séminaire du pôle FR AIB. Deanna Church (Ph.D., Senior Director of Applications à 10x Genomics, présentera l’intérêt de la technologie Chromium, mise en place par la plateforme pour vos projets d’analyse de variants, de phasing et de la caractérisation...
En savoir plus
Un poste d'ingénieur d'études est ouvert au concours interne INRA sur GeT-PlaGe. Extrait du profil de poste : L'Ingénieur(e) recruté(e) assurera l'interface avec les équipes de recherche du département GA, il(elle) participera au conseil aux équipes en lien avec les autres ingénieurs de la plateforme, aux développements...
En savoir plus
GeT a été invitée à présenter son retour d'expérience sur le séquençage de longs fragments à l'événement London Calling 2017 d'Oxford Nanopore Technologies. Résumé : In addition to sequencing of short fragments on Illumina sequencers, GeT platform wished to propose sequencing of long fragments. The main reason...
En savoir plus
Summary of our poster at ONT London Calling 2017, by Catherine Zanchetta et al. EVALUATION OF BASIC PARAMETERS For complex genome assembly, if a shearing and a size selection are performed on long fragments, very long reads can be obtained (40 kb shearing ? N50 =...
En savoir plus
Les candidatures sont à envoyer avant le 15/02/2017 à get-plage.rh@genotoul.fr. Les profils sont disponibles ci-dessous, mais vous trouverez les activités essentielles pour ce poste Participer à la réalisation technique de projets de génotypage : d’analyse d’expression en nanovolume sur le BioMark de chez Fluidigm : accueil des clients, conseils et discussions techniques...
En savoir plus
Cette machine permet de générer des long reads à partir de données générées en Illumina. Le Chromium controller de 10X Genomics est arrivé à GeT-PlaGe! Cette nouvelle technologie devrait nous permettre de faire des assemblages de short-reads Illumina via un système de barcoding unique, rendant accessibles...
En savoir plusNous vous informons que le plateau GeT-TQ s'associe à QIAGEN pour vous proposer un séminaire intitulé "Les nouveaux outils pour réussir la qPCR" qui se tiendra le jeudi 13 octobre 2016 à partir de 10h en salle H. Paris, bat L4, I2MC....
En savoir plus
Barcode, l'outil générique de traçabilité par code-barres, développé depuis 2005 par GeT-PlaGe, a été déployé sur 15 structures en France : Unités Expérimentales, Unités de Recherche, Centres de Ressources Biologiques, Plateformes Technologiques de l'INRA, INSA ou encore INSERM (carte des installations). Le millionième code-barres a été créé sur l'Unité de...
En savoir plus
Avec la montée en puissance des projets, le parc actuel des séquenceurs de GeT-PlaGe tourne à plein régime. Pour pouvoir continuer à vous accompagner sans retarder les projets il était nécessaire d'accroitre nos capacités de production. Nous venons ainsi d'acquérir un deuxième Hiseq3000 doublant ainsi...
En savoir plus
Le séquenceur Ion S5 (Ion Torrent) utilise la technologie de séquençage par semiconducteur. La séquence d’ADN est déterminée en mesurant les variations de pH causées par l’incorporation d’un nucléotide sur le brin complémentaire (détection des ions H+ qui sont dégagés lors de la polymérisation de...
En savoir plus