La plateforme GeT présente, à JOBIM 2017 à Lille, un poster sur les dernières analyses de comparaison de données Long Reads pour l'assemblage de novo de différents génomes (bactérie, champignon, tomate et poisson). Résumé : Thanks to its experience on short reads sequencing using the Illumina technologies,...
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Le 21 juin à 16H, salle de séminaire du pôle FR AIB. Deanna Church (Ph.D., Senior Director of Applications à 10x Genomics, présentera l’intérêt de la technologie Chromium, mise en place par la plateforme pour vos projets d’analyse de variants, de phasing et de la caractérisation...
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Un poste d'ingénieur d'études est ouvert au concours interne INRA sur GeT-PlaGe. Extrait du profil de poste : L'Ingénieur(e) recruté(e) assurera l'interface avec les équipes de recherche du département GA, il(elle) participera au conseil aux équipes en lien avec les autres ingénieurs de la plateforme, aux développements...
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GeT a été invitée à présenter son retour d'expérience sur le séquençage de longs fragments à l'événement London Calling 2017 d'Oxford Nanopore Technologies. Résumé : In addition to sequencing of short fragments on Illumina sequencers, GeT platform wished to propose sequencing of long fragments. The main reason...
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Summary of our poster at ONT London Calling 2017, by Catherine Zanchetta et al. EVALUATION OF BASIC PARAMETERS For complex genome assembly, if a shearing and a size selection are performed on long fragments, very long reads can be obtained (40 kb shearing ? N50 =...
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Les candidatures sont à envoyer avant le 15/02/2017 à get-plage.rh@genotoul.fr. Les profils sont disponibles ci-dessous, mais vous trouverez les activités essentielles pour ce poste Participer à la réalisation technique de projets de génotypage : d’analyse d’expression en nanovolume sur le BioMark de chez Fluidigm : accueil des clients, conseils et discussions techniques...
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Cette machine permet de générer des long reads à partir de données générées en Illumina. Le Chromium controller de 10X Genomics est arrivé à GeT-PlaGe! Cette nouvelle technologie devrait nous permettre de faire des assemblages de short-reads Illumina via un système de barcoding unique, rendant accessibles...
En savoir plusNous vous informons que le plateau GeT-TQ s'associe à QIAGEN pour vous proposer un séminaire intitulé "Les nouveaux outils pour réussir la qPCR" qui se tiendra le jeudi 13 octobre 2016 à partir de 10h en salle H. Paris, bat L4, I2MC....
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Barcode, l'outil générique de traçabilité par code-barres, développé depuis 2005 par GeT-PlaGe, a été déployé sur 15 structures en France : Unités Expérimentales, Unités de Recherche, Centres de Ressources Biologiques, Plateformes Technologiques de l'INRA, INSA ou encore INSERM (carte des installations). Le millionième code-barres a été créé sur l'Unité de...
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Avec la montée en puissance des projets, le parc actuel des séquenceurs de GeT-PlaGe tourne à plein régime. Pour pouvoir continuer à vous accompagner sans retarder les projets il était nécessaire d'accroitre nos capacités de production. Nous venons ainsi d'acquérir un deuxième Hiseq3000 doublant ainsi...
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