Chromium
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
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Chromium

10X Genomics - Chromium

10X Genomics – Chromium

MODES D’ACCÈS

  • GeT-PlaGe (annuaire) :
    • Machine uniquement utilisée par le personnel interne au bénéfice des équipes de recherche

APPLICATIONS

  • Préparation de librairies pour assemblages de short-reads Illumina via un système de barcoding unique
    • Séquençage de novo
    • Phasing
    • Analyses de transcriptome single cell (3′, 5′, VDJ, ATAC-Seq, CITE-Seq…)

CARACTÉRISTIQUES

  • Barcoding en émulsion
  • 4 millions de barcodes
  • 1 ng d’ADN de plus de 50 kb nécessaire
  • 100 à 80000 cellules encapsulées en 7 minutes
  • 8 échantillons traités en 1 run

MAINTENANCES

  • GeT-PlaGe :
    • Machine sous contrat de maintenance

INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES

  • Application Génomique validée le 29/09/2017 (GeT-PlaGe)
  • Application Single-Cell validée (GeT-Santé)
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