Chromium

10X Genomics – Chromium

MODES D’ACCÈS

• GeT-PlaGe (annuaire) :
  • Machine uniquement utilisée par le personnel interne au bénéfice des équipes de recherche

APPLICATIONS

• Préparation de librairies pour assemblages de short-reads Illumina via un système de barcoding unique
  • Séquençage de novo
  • Phasing
  • Analyses de transcriptome single cell (3′, 5′, VDJ, ATAC-Seq, CITE-Seq…)

CARACTÉRISTIQUES

• Barcoding en émulsion
• 4 millions de barcodes
• 1 ng d’ADN de plus de 50 kb nécessaire
• 100 à 80000 cellules encapsulées en 7 minutes
• 8 échantillons traités en 1 run

MAINTENANCES

• GeT-PlaGe :
  • Machine sous contrat de maintenance

INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES

• Application Génomique validée le 29/09/2017 (GeT-PlaGe)
• Application Single-Cell validée (GeT-Santé)