Aviti

MODES D’ACCÈS

• GeT-PlaGe (annuaire) :
  • 3 machines accessible par le personnel PlaGe

APPLICATIONS

• Re-séquençage
• Analyses d’expression
• Séquençage de novo
• ChiP-seq
• Analyses épi-génétiques
• Séquençage de produits PCR

CARACTÉRISTIQUES

• Longueur des séquences maximum attendues : 150b (2 x 150 b en paired-ends) ou 300b (2 x 300 b en paired-ends)
• 2 types de kits disponibles : 2×150 b High Output ou 2×300 b Medium Output
• 1 flowcell de 2 lanes (indépendantes en 2×150 b High Output ou dépendantes en 2×300 b Medium Output)
• 150 Gb / lane 2×150 b High Output
• 60 Gb/ lane 2×300 b Medium Output
• Moins de 2% d’erreur sur les séquences alignées sur le génome de contrôle (PhiX)
• Possibilité de multiplexage
• 37 h pour un run de séquençage 2×150 b High Output ou 51 h pour un run de séquençage 2×300 b Medium Output

MAINTENANCES

• GeT-PlaGe :
  • Maintenance chaque semaine assurée par le personnel plateforme
  • Maintenance annuelle par le fournisseur

INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES

• Durée d’accréditations, réservations et conservations des données