Direction
- Directrice d’unité : Claire Kuchly – Tél. 05 61 28 57 54 –
- Directeur d’unité adjoint : Jérome Lluch
Description / spécificités
Depuis 2001, la plateforme GeT-PlaGe est une infrastructure de recherche en génomique et transcriptomique au cœur de l’innovation scientifique. Certifiée ISO 9001 (depuis 2008) et NF X50-900 (depuis 2015), elle s’appuie sur une expertise scientifique et technique reconnue pour accompagner les projets de recherche dans les sciences animales, végétales, de l’environnement, de l’alimentation et de la santé.
Ses principales missions sont :
- Développer et mettre à disposition des outils et méthodes innovants
- Séquençage haut-débit (short-reads et long-reads)
- Assemblage et annotation de génomes
- Analyse du polymorphisme et des variants structuraux
- Étude du transcriptome et de la régulation de l’expression des gènes (dont épigénétique)
- Analyse de métagénomes et microbiomes
- Accompagner les chercheurs et partenaires
- Conseil dans le design expérimental et le choix des approches technologiques
- Production de données de haute qualité adaptées aux besoins des projets
- Suivi et accompagnement tout au long des projets pour établir une relation de confiance durable
- Valoriser et diffuser les connaissances
- Implication dans des projets ambitieux et collaboratifs à forte valeur ajoutée
- Participation active à la publication et au partage des données (data papers, open data)
- Communication scientifique (congrès, réseaux nationaux et internationaux)
- Maintenir un haut niveau d’exigence et d’amélioration continue
- Engagement qualité à travers les certifications ISO et NF
- Implication forte du personnel, garantissant expertise, réactivité et fiabilité
- Adaptation permanente aux évolutions technologiques et aux besoins de la communauté
Outils
- Annuaire
- Intranet (réservé aux utilisateurs)
- Système d’information
Equipements
- Matériel phare disponible sur GeT-PlaGe :
- PromethION (Oxford Nanopore Technologies)
- GridION (Oxford Nanopore Technologies)
- VEGA (PacBio)
- AVITI (Element Biosciences)
- Liste exhaustive des équipements accessibles sur après formation, ou dans le cadre de la réalisation de votre projet par l’équipe GeT-PlaGe.
Perspectives
Accès
- public/privé.
- Projets moyen/haut débit sur toutes espèces.
Qualité
CONTACT
GeT-PlaGe (Plateforme Génomique)
Centre INRAE Occitanie
24 chemin de borde rouge – Auzeville
CS 52627
31326 CASTANET-TOLOSAN Cedex