Vega

Le VEGA est un séquenceur long-reads HiFi au format benchtop, conçu pour rendre la technologie PacBio HiFi plus accessible ; il se positionne comme le successeur compact du Sequel II, tout en partageant le même écosystème de préparations, logiciels d’analyse (SMRT Link) et workflows.

MODES D’ACCÈS

• GeT-PlaGe (annuaire) :
  • Machine uniquement utilisée par le personnel interne

APPLICATIONS

• Assemblage de génomes et détection de variants (SNV, indels, SV).
• Transcriptomique complète (Iso-Seq)
• Analyse de la méthylation native (sans traitement chimique)
• Panels ciblés: détection précise dans les régions complexes (répétées, expansions)
• Métagénomique et microbiologie.

CARACTÉRISTIQUES

• Débit par run : jusqu’à 60 Gb de données HiFi (1 SMRT Cell).
• Longueur des lectures : ≥ 20 kb (HiFi).
• Précision : ≥ 99,9 % (Q30+).
• Sortie par run : fichiers hifi_reads.bam, intégrant basecalling, démultiplexage, DeepConsensus.
• Compatibilité : workflows et réactifs HiFi existants

MAINTENANCES

• GeT-PlaGe :
  • Maintenance requise

INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES

• Machine validée en juin 2025
• Conservations des données