Barcode, l'outil générique de traçabilité par code-barres, développé depuis 2005 par GeT-PlaGe, a été déployé sur 15 structures en France : Unités Expérimentales, Unités de Recherche, Centres de Ressources Biologiques, Plateformes Technologiques de l'INRA, INSA ou encore INSERM (carte des installations). Le millionième code-barres a été créé sur l'Unité de...
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Avec la montée en puissance des projets, le parc actuel des séquenceurs de GeT-PlaGe tourne à plein régime. Pour pouvoir continuer à vous accompagner sans retarder les projets il était nécessaire d'accroitre nos capacités de production. Nous venons ainsi d'acquérir un deuxième Hiseq3000 doublant ainsi...
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Le séquenceur Ion S5 (Ion Torrent) utilise la technologie de séquençage par semiconducteur. La séquence d’ADN est déterminée en mesurant les variations de pH causées par l’incorporation d’un nucléotide sur le brin complémentaire (détection des ions H+ qui sont dégagés lors de la polymérisation de...
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Aurelien Bancaud (chercheur au LAAS-CNRS de Toulouse) nous a présenté ses découvertes dans le domaine de la détection, de la quantification et de la concentration d'échantillons d'ADN très faiblement concentrés (moins de 1ng par ml) et des évolutions à venir pour les échantillons d'ADN de haut poids moléculaire, ce...
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La Plateforme GeT a organisé à Toulouse sa journée annuelle sur le thème « Retour d’expériences séquençage long reads » le 27 mai 2016 Site INRA Auzeville Quelques présentations sont maintenant disponibles, merci aux orateurs de nous avoir donner leur accord pour leur diffusion. Pour introduire la technologie PacBio (qui a pu manquer...
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The presentations of talk and the notes of workshop of Pacific Biosciences User Group Meeting are available. Different applications were presented: Breakout Presentations: Best practice DNA prep for SMRT - Olga Vinnere Pettersson, PhD Isoform sequencing - Anna Bratus Large insert library preparation - Baptiste Mayjonade Amplicon...
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La plateforme GeT-PlaGe a finalisé l’installation d’un séquenceur PacBio RSII de Pacific Biosciences. Cet outil de séquençage de molécules uniques en temps réel, vient compléter les technologies HISEQ , MISEQ, Proton et PGM déjà présentes sur la plateforme GeT de Toulouse. L’intérêt du PacBio réside dans la...
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