GeT | GeT-TQ
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
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GeT-TQ

Responsable opérationnel

Description/spécificités

En tant que porte d’entrée des problématiques de la communauté « santé » au sein de la plateforme GeT, le plateau GeT-TQ est à même de mettre en relation cette communauté avec l’interlocuteur le plus approprié de la Plateforme GeT.

Dans le domaine de la quantification des transcrits, il met à disposition ou propose en service, les technologies de bas, à haut-débit en qPCR (StepOne, ViiA7, Biomark) et par ddPCR (QX200). Il dispose de divers outils permettant le contrôle qualité de vos échantillons (NanoDrop, DropSense, Fragment Analyzer).

Au sein de GeT, le plateau a développé une approche analytique « single cell » à travers des outils comme le C1 Fluidigm ou le Chromium de 10X Genomics lui permettant de proposer ses services dans ce domaine (expression génique sur cellule unique, séquençage DNA ou RNA sur cellule unique).
La préparation des librairies, après Ribodéplétion des ARN, et avant séquençage sur machine Illumina fait également partie des services qu’il propose.

Outils

Equipement

  • Matériel phare :
    • C1 Single Cell Auto Prep System (Fluidigm)
    • Fragment Analyzer (AATI), NanoDrop ND-2000 (Thermo), DropSense16 (Trinean)
    • ABI StepOnePlus, ViiA7 et Veriti (LifeTech)
  • Liste exhaustive des équipements

Perspectives

  • Mise en place d’un traitement bioinformatique des projets allant du design des sondes et/ou oligos jusqu’à l’analyse statistique des résultats.

Accès

  • public/privé.

CONTACT

Plateau Transcriptomique Quantitative (TQ)
INSERM Rangueil
Bât L4, 2ème étage, pièce 245,
BP84255 31432 TOULOUSE Cedex 4
Tel: 05 61 32 56 08 ou 05 61 32 56 49
Fax: 05 61 32 56 23
get-tq@genotoul.fr

Situation géographique

Quelques indications pour venir en fonction de votre moyen de transport ici .