GeT-TRiX

Responsable opérationnel

• Yannick Lippi – Tél. 05 82 06 64 01 –

Description/spécificités

• La Plateforme TRiX est dédiée aux études transcriptomiques par qPCR et par RNAseq. Les activités de la plateforme reposent sur différentes compétences de biologie moléculaire et de bio-informatique, pour fournir un service clé en main de l’échantillon d’ARN jusqu’au rapport d’analyse.

Outils

• Intranet (réservé aux utilisateurs)
• Système d’information

Equipement

• Liste exhaustive des équipements

Service

• Préparation des librairies RNAseq pour diverses applications :
  • Séquençage orienté des ARN polyadénylés : mRNAseq
  • Séquençage orienté rationalisé des ARN polyadénylés : 3’mRNAseq
  • Séquençage orienté des ARN non polyadénylés (ribo-déplétion) : Total RNAseq
  • Séquençage des petits ARNs non codants : SmallRNAseq (miRNA, ….)
• Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données RNAseq.
• qPCR 384 puits
  • Analyse des acides nucléiques, distribution des échantillons et réactifs à l’aide d’un automate. Analyse qPCR. Aide à la mise en place des projets.

Perspectives

• Développement d’outils pour le RNAseq
• Développement de protocoles personnalisables en fonction de besoins spécifiques (faible quantité, faible qualité)

Accès

• public/privé.

CONTACT

Plateforme GeT-TRiX
ToxAlim UMR1331 INRAe/INP/UPS
180, chemin de Tournefeuille BP93173
31027 Toulouse Cedex 3
Fax: +33 582 06 64 01