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Megaruptor3 de Diagenode, nouveau venu sur la plateforme GeT-PlaGe
Le Mégaruptor 3 a profité de l’été pour faire son apparition sur la plateforme. Cet outil, plus performant que son petit frère le Mégaruptor 1, permet de couper l’ADN génomique en fragments de tailles variables allant de 5 à 100kb et de fragmenter 8 échantillons en parallèle....
En savoir plusMegaruptor 1 et 3
MODES D’ACCÈS GeT-PlaGe (annuaire) : Machine accessible par le personnel plateforme Machine soumise à réservation APPLICATION Préparation de librairies CARACTÉRISTIQUES Les Megaruptors 1 et 3 sont des appareils permettant la préparation de librairie avant séquençage Découpent mécaniquement les fragments à une taille souhaitée à l’aide de seringues...
En savoir plusLong reads : Acquisition du Chromium de 10X Genomics
Cette machine permet de générer des long reads à partir de données générées en Illumina. Le Chromium controller de 10X Genomics est arrivé à GeT-PlaGe! Cette nouvelle technologie devrait nous permettre de faire des assemblages de short-reads Illumina via un système de barcoding unique, rendant...
En savoir plusLes sites GeT en mode reprise
Les sites de GeT ont tous repris une partie de leurs activités chacun en fonction de leurs contraintes. ♦ Le site GeT-Biopuces sur TBI a également repris depuis début juin dans le respect des mesures sanitaires avec la totalité du personnel. Les projets ont pu...
En savoir plusLe retour des premiers agents sur GeT-PlaGe ! Venez découvrir l’article réalisé par INRAe Occitanie Toulouse
Dans la semaine du 22 mai 2020, Cécile Donnadieu, directrice de l’unité de service GeT-PlaGe a été interviewée pour parler de la reprise sur site de l’activité et de comment cette période de confinement s’est déroulée pour elle et les agents de la plateforme....
En savoir plusLe Ion S5™ remplace le Ion Proton sur GeT-Biopuces
Le séquenceur Ion S5 (Ion Torrent) utilise la technologie de séquençage par semiconducteur. La séquence d’ADN est déterminée en mesurant les variations de pH causées par l’incorporation d’un nucléotide sur le brin complémentaire (détection des ions H+ qui sont dégagés lors de la polymérisation de...
En savoir plusLancement des runs mutualisés pour le séquençage de petits génomes en PacBio HiFi
GeT-PlaGe vous propose un service de mutualisation pour le séquençage HiFi de petits génomes (bactérie ou champignon) grâce à la technologie PacBio. Nous vous proposons un run mutualisé PacBio qui pourra être lancé tous les 2-3 mois. Rien est plus génome de 5Mb simple car...
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