GeT | Valorisation 2017
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
1009
page-template-default,page,page-id-1009,page-child,parent-pageid-927,ajax_fade,page_not_loaded,smooth_scroll,,qode-theme-ver-3.8,wpb-js-composer js-comp-ver-5.4.5,vc_responsive
 

Valorisation 2017

Notre participation à la production scientifique

Projets en collaboration

  • DNA-HIC (2015-2017): Molecular characterization and modeling of a bacterial DNA segregation apparatus
  • PigLetBiota (2014-2019): Une étude de biologie intégrative de l’influence du microbiote intestinal sur la robustesse des porcelets
  • Treasure (2015-2019- H2020): Treatment and Sustainable Reuse of Effluents in semiarid climates
  • Bovano (2015-2017): IDENTIFICATION AND FUNCTIONAL STUDY OF CATTLE DELETERIOUS MUTATIONS
  • Feed-A-Gene (2015-2020 – H2020) : projet européen pour améliorer l’efficacité alimentaire des monogastriques
  • SELGEN – GenSSeq: développement et la mise en œuvre des méthodes à haut débit permettant d’estimer la valeur génétique des animaux et végétaux
  • Agri-Métatranscriptomique – diversité: Nouvelles perspectives dans l’étude des communautés microbiennes complexes
  • HeliOr (2015-2018) : Séquençage du Génome de l’Orobanche et 2ème génotype Tournesol dans le cadre de SUNRISE
  • Meta-Pac (2015-2018): Mise au point des analyses de Metagénomique long read
  • EUCLEG_URP3F (2017-) Européen : Breeding forage and grain legumes to increase EU’s and China’s protein self-sufficiency
  • STURGEoNOMICS COFASP (2017 – ): Genome-based approaches for improvement of aquaculture in two marine sturgeon species: Atlantic sturgeon and Beluga
  • Sex’nPerch FEAMP (2017-) CRB Anim: Genome sequencing of the European Perch, Perca fluviatilis, to improve sex-control for a better management of the perch’s CRB-Anim genetic resources
  • GenoFish ANR (2017 – ): Evolution of genes and genomes after whole genome duplication
  • Genesea FEAMP (2017- ): Développement et validation d’une procédure de sélection génomique chez le bar et la daurade pour améliorer la résistance à des pathologies
  • DG-PHYTOM CASDAR (2017- ): Spectre d’action et déterminisme génétique de la résistance à Phytophthora infestant chez 12 tomates sauvages pour construire des résistances durables au mildiou

Publications

Comparative Analysis of Ralstonia solanacearum Methylomes
Ivan Erill, Marina Puigvert, Ludovic Legrand, Rodrigo Guarischi-Sousa, Céline Vandecasteele, João C. Setubal, Stephane Genin, Alice Guidot and Marc Valls
Frontiers in Plant Science (2017) April 2017 | Volume 8 | Article 504, doi: 10.3389/fpls.2017.00504

Diversity and evolution of plastomes in Saharan mimosoids:potential use for phylogenetic and population genetic studies
Mohamed Mensous, Céline Van de Paer, Sophie Manzi, Olivier Bouchez, Djamel Baâli-Cherif, Guillaume Besnard
Tree Genetics & Genomes (2017) 13:48, DOI 10.1007/s11295-017-1131-2

Long noncoding RNA repertoire in chicken liver and adipose tissue
Kévin Muret, Christophe Klopp, Valentin Wucher, Diane Esquerré, Fabrice Legeai, Frédéric Lecerf, Colette Désert, Morgane Boutin, Frédéric Jehl, Hervé Acloque, Elisabetta Giuffra, Sarah Djebali, Sylvain Foissac, Thomas Derrien and Sandrine Lagarrigue
Genet Sel Evol (2017) 49:6, DOI 10.1186/s12711-016-0275-0

Draft Genome Sequence of DesulfovibrioBerOc1, a Mercury-Methylating Strain
Marisol Goñi Urriza, Claire Gassie, Oliver Bouchez, Christophe Klopp, Rémy Guyoneaud
American Society For Microbiology, Volume 5 Issue 3 e01483-16

Whole-genome analysis of introgressive hybridization and characterization of the bovine legacy of Mongolian yaks
Ivica Medugorac, Alexander Graf, Cécile Grohs, Sophie Rothammer, Yondon Zagdsuren, Elena Gladyr, Natalia Zinovieva, Johanna Barbieri, Doris Seichter, Ingolf Russ, André Eggen, Garrett Hellenthal, Gottfried Brem, Helmut Blum, Stefan Krebs & Aurélien Capitan
Nature Genetics, doi:10.1038/ng.3775

Posters/Présentations