GeT | Séquençage haut-débit (NGS)
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
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Séquençage haut-débit (NGS)

HiSeq3000

Cellule unique, GeT-PlaGe, Séquençage nouvelle génération
Illumina-MiSeq

MiSeq

Accès autonome, Cellule unique, GeT-PlaGe, Séquençage nouvelle génération
Thermo Fisher scientific Ion S5

Ion S5

GeT-BioPuces, Séquençage nouvelle génération

Ion PGM

GeT-Purpan, Séquençage nouvelle génération

PacBio RSII

GeT-PlaGe, Séquençage nouvelle génération
10X Chromium

Chromium

Cellule unique, GeT-PlaGe, Séquençage nouvelle génération

MinION

GeT-PlaGe, Séquençage nouvelle génération

C1

Cellule unique, GeT-TQ, Séquençage nouvelle génération

Cet atelier propose différents types de technologies permettant de faire du séquençage haut-débit et longs fragments. Ces séquenceurs de nouvelle génération (NGS) permettent de réaliser des programmes de :

  •  Séquençage de novo
  •  Reséquençage de régions d’intérêt (génomes entiers/régions candidates)
  •  Analyses Transcriptomiques
  •  Analyses Epigénétiques (Etudes de Méthylation)
  •  Analyses Métagénomiques
  •  Analyses d’interaction ADN/protéine (ChiP-seq)
  •  Identification et quantification de petits ARN