GeT | Scanner Agilent
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
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Scanner Agilent

Agilent Scanner

Agilent Scanner

MODES D’ACCÈS

  • GeT-TRiX (annuaire) :
    • Machine soumise à réservation, accessible après formation

APPLICATION

  • Scan des microarrays Agilent tous formats.
  • Analyse des images avec Agilent Feature Extraction

CARACTÉRISTIQUES

  • Le scanner Agilent possède la capacité de générer des images au format TIFF 20 bits. Cette caractéristique lui confère une gamme dynamique accrue permettant une quantification efficace des faibles signaux tout en limitant la présence de spots saturés
  • La calibration des PMT est réalisée automatiquement par le scanner grâce à une LED intégrée et à une calibration réalisée à l’installation
  • Il permet de scanner simultanément les 2 fluorochromes Cy3 et Cy5 et Alexa 647, 555, et 660
  • Carroussel pour 48 lames
  • Résolution : 2, 3, 5 ou 10 µm
  • Temps de scan : env. 5 min par lame à la résolution de 5 µm
  • Images au format TIFF 16 ou 20 bits
  • Calibration automatique des PMT
  • Scan automatique jusqu’à 48 lames (carrousel)
  • Scanner sous caisson de protection anti-ozone

MAINTENANCES

  • GeT-TRiX :
    • Machine sous contrat de maintenance

LOGICIELS

  • Scan control
  • Feature Extraction

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