GeT | PacBio RSII
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
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PacBio RSII

Pacific BioSciences RSII

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MODES D’ACCÈS

APPLICATIONS

  • Améliorer les assemblages ou réaliser des analyses de génomes de novo
  • Caractériser des variations génétiques
  • Séquencer de grands amplicons (long range)
  • Séquencer des cDNA pleine longueur
  • Réaliser des analyses de méthylation

CARACTÉRISTIQUES

  • environ 50 000 puits actifs par SMRT Cell
  • Longueur des séquences jusqu’à plusieurs dizaines de kilobases
  • Unité de séquençage = SMRT Cell
  • Possibilité de lancer le séquençage de 16 SMRT Cell en un seul batch
  • Durée de run : 4 heures
  • Débit : entre 500Mb et 1Gb de données avant nettoyage
  • 50% des reads plus longs que 14kb
  • 5% des reads plus longs que 24kb
  • Longueur maximale des reads : 40kb

MAINTENANCES

  • GeT-PlaGe :
    • Machine sous contrat de maintenance

INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES

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