GeT | Ion S5
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
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Ion S5

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MODES D’ACCÈS

APPLICATION

  • Séquençage ADN
    • Séquençage de novo de petits génomes (bactéries, levures, algues, etc…)
    • Re-séquençage sur référence
    • Séquençage ciblé d’amplicons (Ampliseq : https://www.ampliseq.com/panels/search.action)
    • ChIP-seq
    • Métagénomique 16S
  • Séquençage ARN
    • RNA seq (séquençage orienté)
    • Séquençage de micro-ARNs et petits ARNs

CARACTÉRISTIQUES

  • Longueur des séquences : 200 et 400 pb (suivant la puce)
  • 2-5 et 15Gb / puces 520-530 et 540
  • Réalisation de la PCR en émulsion avec le module One Touch 2
  • Nombre d’échantillons séquencés : possibilité de multiplexage (96 index pour l’ADN et 16 index pour l’ARN)
  • Performances : 2h30 en 200pb et 5h en 400pb

MAINTENANCES

  • GeT-Biopuces:
    • Machine sous contrat de maintenance
    • Maintenance après chaque run assurée par le personnel plateforme
    • Maintenance annuelle assurée par le fournisseur

LOGICIELS

INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES

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