GeT | C1
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
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C1

Fluidigm - C1

Fluidigm – C1

MODES D’ACCÈS

  • GeT-TQ (annuaire) :
    • Machine soumise à réservation, accessible après formation

APPLICATION

  • PCR quantitative haut débit (96 gènes d’intérêt x 96 cellules)
  • Séquençage NGS (mRNASeq, DNASeq)

CARACTÉRISTIQUES

  • Capture de cellules de 5 à 25µm
  • 3 types de puces 5-10µm, 10-17µm et 17-25µm
  • Workflow effectué de façon automatique par le C1 :
    • Marquage des cellules avec la Calcéine (acide nucléiques), Homodimère d’Ethidium (perméabilité membranaires)
    • Vérification du nombre, de la forme et de la viabilité des cellules capturées à l’aide d’un microscope à fluorescence
    • Lyse cellulaire
    • Reverse Transcription des ARNs messagers
    • Amplification Spécifique (STA) de 1 à 96 gènes d’intérêts
    • Récupération des cDNAs correspondant à 1 cellule

MAINTENANCES

  • GeT-TQ :
    • Machine sous contrat de maintenance

LOGICIELS

  • Analyse des résultats : script SINGuLAR sur R.

INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES

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