GeT | GeT-TRiX
GeT : plateforme de Génomique et transcriptomique
ARN, Transcriptomique, RNA, Transcriptomics, ADN, génomique, DNA, genomics, cellule unique, single cell, Polymorphisme, polymorphism, NGS, Next Generation Sequencing , puces à ADN, microarrays, qPCR à Haut Débit (qPCR HD), High throughput Quantitative PCR, Analyses bioinformatiques et biostatistiques de données, Bioinformatics and biostatistical analysis
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GeT-TRiX

Responsable opérationnel

Description/spécificités

  • Le Plateau TRiX est dédié aux études transcriptomiques (gene expression ou microRNA) sur puces à ADN Agilent. Il dispose d’une chaine d’analyse de microarrays Agilent (bioanalyzer, four d’hybridation, scanner) et a développé un service intégrant le contrôle qualité des échantillons et l’analyse statistique des résultats pour les études sur le transcriptome (expression et microRNA). La préparation des marquages des ARNs a été automatisée sur robot de distribution, ce qui permet de produire jusqu’à 96 transcriptomes en parallèle (pour microarrays d’expression).

Outils

Equipement

Service

  • Microarrays Agilent
    • Analyse sur microarray Gene Expression ou microRNA.
    • Analyse des acides nucléiques et marquage des ARN automatisé (jusqu’à 96 échantillons en parallèle). Hybridation, lavages et lecture des puces Agilent. Aide à la mise en place des projets. Rapport d’analyse des données incluant une recherche des gènes différentiellement exprimés et analyses fonctionnelles (enrichissement de catégories fonctionnelles GO/KEGG parmi les clusters de gènes régulés co-exprimés.
  • qPCR 384 puits
    • Analyse des acides nucléiques, distribution des échantillons et réactifs à l’aide d’un automate. Analyse qPCR. Aide à la mise en place des projets.

Perspectives

  • Développement des outils de NGS pour l’épigénétique et le RNAseq

Accès

  • public/privé.

CONTACT

Plateau GeT-TRiX
ToxAlim UMR1331 INRA/INP/UPS
180, chemin de Tournefeuille BP93173
31027 Toulouse Cedex 3
Fax: +33 582 06 64 01
get-trix@genotoul.fr

Situation géographique

Quelques indications pour venir en fonction de votre moyen de transport ici .