• GeT PlaGe

APPLICATIONS

• Re-séquençage
• Séquençage de novo de petits génomes
• Séquençage Amplicons
• Tests des Librairies destinées à être séquencées sur l'Hiseq 2000

CARACTERISTIQUES CONSTRUCTEUR

• Longueur des séquences attendues : 150 pb (2 x 150 pb en paired-ends)
• 1Gb / flowcell (2 x 150 pb en paired-end)
• Moins de 2% d'erreur sur les séquences alignées sur le génome de contrôle (PhiX)

NOMBRE D'ECHANTILLONS SEQUENCES

• 1 flowcell de 1 lane
• Possibilité de multiplexage (24 index)

PERFORMANCES

• 1 jour pour un run de séquençage en paired-end 2x150 pb

MAINTENANCE

• Maintenance après chaque run assurée par le personnel plateforme
• Maintenance annuelle assurée par le fournisseur

INFORMATIONS COMPLEMENTAIRES

• Durée d'accréditations, réservations et conservations des données

• GeT Biopuces
• GeT TRIX

APPLICATION

• Hybridation automatisée de puces à ADN

CARACTERISTIQUES

• Four d’hybridation pour différents types de microarrays Agilent quel que soit le format
• Rack rotatif acceptant jusqu’à 24 unités d’hybridation

TYPE D'ECHANTILLONS

• Chambres d’hybridation Agilent

PERFORMANCES

• Gamme de température de 5° à 70°C (± 0.10°C)
• Contrôle de la vitesse de rotation de 5 à 20 RPM

MAINTENANCES

• Maintenance annuelle constructeur

• GeT TRIX

APPLICATION

• Scan des microarrays Agilent tous formats. Analyse des images avec Agilent Feature Extraction

CARACTERISTIQUES

• Le scanner Agilent possède la capacité de générer des images au format TIFF 20 bits. Cette caractéristique lui confère une gamme dynamique accrue permettant une quantification efficace des faibles signaux tout en limitant la présence de spots saturés
• La calibration des PMT est réalisée automatiquement par le scanner grâce à une LED intégrée et à une calibration réalisée à l'installation
• Il permet de scanner simultanément les 2 fluorochromes Cy3 et Cy5 et Alexa 647, 555, et 660

NOMBRE D'ECHANTILLONS

• Carrousel pour 48 lames

PERFORMANCES

• Résolution : 2, 3, 5 ou 10 µm
• Temps de scan : env. 5 min par lame à la résolution de 5 µm
• Images au format TIFF 16 ou 20 bits
• Calibration automatique des PMT
• Scan automatique jusqu'à 48 lames (carrousel)
• Scanner sous caisson de protection anti-ozone

MAINTENANCES

• Appareil sous garantie et contrat de maintenance

LOGICIELS

• Agilent Scan Control
• Agilent Feature Extraction

• GeT TRIX

APPLICATION

• PCR quantitative en temps réel (qPCR) format 384 puits
• Courbe standard, Delta Ct, Génotypage, Présence/Absence
• Courbes de fusion haute résolution (HRM : High Resolution Melting curves) pour les applications de génotypage, épigénétiques, etc…

CARACTERISTIQUES

• Multiplexage: 6 filtres d’excitation (450-670 nm) et 6  emission (500-720)
• HRM possible

NOMBRE D'ECHANTILLONS

• Bloc 384 puits (5-20 µL)

PERFORMANCES

• Uniformité de température: ±0.5°C dans les 30 sec
• Run d’environ 35 min pour une plaque 384-puits
• Quantification précise: Détecte un fold-change de 1.5 sur simplex
• Sensibilité jusqu’à une seule copie

MAINTENANCES

• Appareil sous garantie et contrat de maintenance

LOGICIELS

• Viia7 RUO software avec module HRM

• GeT TRIX

APPLICATION

• Appareil de PCR au format 96 puits

CARACTERISTIQUES

• Bloc 96 puits

NOMBRE D'ECHANTILLONS

• De 1 à 96 échantillons

PERFORMANCES

• 96 points PCR par 2 h
• Volume de 10 à 200 µl
• Maximum ramp rate : 5°C/sec
• Average ramp rate : 3.3°C/sec
• Température comprise entre 0 et 100°C
• Précision ± 0.2°C à 90°C
• Uniformité de chaque bloc  ± 0.4°C (mesurée dans les 10 sec à 90°C)
• Gradient: 
  • Précision +0.2°C en fin de ligne
  • Uniformité des lignes : +0.4°C puits à puits (mesurée dans les 10 sec)
  • Etendue du gradient : 30-100°C
  • Gamme de température : 1-24°C

MAINTENANCES

• Appareil sous garantie

LOGICIELS

• Windows CE 6.0

• GeT TRIX

APPLICATION

• Manipulation de liquides en formats tubes 1,5-2 mL ou plaques 96, 384 ou 1536 puits

CARACTERISTIQUES

Le Bravo est un automate de pipetage compact (9 positions SBS) pour la manipulation de liquides aux formats tubes 1,5-2 mL ou plaques 96, 384 ou 1536 puits. Il est doté de deux têtes de pipetages au format 96 puits :

• Une tête 96LT acceptant des cônes "large volume" pour des pipetages de 2 à 250 µL
• Une tête 96ST acceptant des cônes "faible volume" pour des pipetages de 300 nL à 70 µL

NOMBRE D'ECHANTILLONS

• Variables, fonction des applications

PERFORMANCES

• Précision de pipetage : CV<5% dans la gamme 300 nL – 250 µL
• Automate précis et rapide, particulièrement adapté au set-up de qPCR au format 384-1536 puits
• Préparation des plaques de qPCR 384 puits en 5 à 25 minutes en fonction de la complexité des pipetages

MAINTENANCES

• Appareil sous garantie et contrat de maintenance

LOGICIEL

• VWorks

• GeT TRIX

APPLICATION

• Contrôle qualité et dosage de la concentration des échantillons

CARACTERISTIQUES

• Le spectrophotomètre UV-Visible BioSpec -nano permet d’effectuer des mesures précises de micro-volumes d’échantillons (1 à 2 µl) avec une reproductibilité optimale.
• Il assure un nettoyage automatique de la cellule de mesure.

TYPE D'ECHANTILLONS

• Mesure d'un échantillon à la fois
• Programmes prédéfinis pour acides nucléiques (ADN, ARN, oligonucléotides) marqués ou non par des fluorophores courants et pour le dosage des protéines

PERFORMANCES

• Mesure de l'absorbance entre 220 et 800 nm en quelques secondes
• Largeur de bande 3 nm, précision ±1 nm

MAINTENANCES

• Appareil sous garantie jusqu'à fin 2011. Le plateau TRiX fera réaliser par le fournisseur les réparations éventuellement nécessaires au-delà de la garantie

• GeT TRIX

APPLICATION

• Broyage d’échantillons à température ambiante ou à froid

CARACTERISTIQUES

• Broyage par billes
• Vitesse de 4 à 6,5 m/s
• Temps de broyage de  40 secondes voire moins
• Taille des échantillons jusqu’à 40g

NOMBRE D'ECHANTILLONS

• Portoir à température ambiante : 24 tubes de 2mL
• Portoir pour broyage à froid (carboglace) : 24 tubes de 2mL

PERFORMANCES

• Broyage de 24 échantillons en quelques secondes (temps fonction de l’échantillon)

MAINTENANCES

• Appareil sous garantie

• GeT TRIX

APPLICATION

• Automatisation de l'électrophorèse d'ADN
• Contrôle qualité, taille et dosage des échantillons d'ADN (produits de PCR, plasmides digérés ou non, etc.)
• Appareil particulièrement adapté aux génotypages réalisés par PCR standard

CARACTERISTIQUES

• Le MultiNA est un automate pour réaliser l'électrophorèse en micro-canaux de 1 à 96 échantillons d'ADN.
• Faible coût d'analyse grâce aux micropuces réutilisable
• Rapidité d’analyse : 75 sec/Analyse
• Sensibilité de détection: le détecteur est 10 fois plus sensible que le marquege au BET 
• Bonne résolution et reproductibilité 

NOMBRE D'ECHANTILLONS

• De 1 à 96 échantillons

PERFORMANCES

• Électrophorèse automatisée de 96 échantillons en 3 heures environ
• Précision sur la taille des fragments +/- 10 bp

MAINTENANCES

• Appareil sous garantie jusqu'à fin 2011. Le plateau TRiX fera réaliser par le fournisseur les réparations éventuellement nécessaires au-delà de la garantie

• GeT Biopuces

APPLICATION

• Scanner à fluorescence pour lames de verre

CARACTERISTIQUES 

• Acquisition simultanée de signaux fluorescents sur lames de verre à deux longueurs d'onde (532 et 635 nm). Cette lecture repose sur l'usage de deux lasers non confocaux. L'appareil permet donc la visualisation et l'analyse de données issues de micro réseaux d'ADN avec une résolution allant de 2 à 40 microns. Le scanner dispose d'outils informatiques et logiciels dédiés à l’analyse d’image.

TYPE D'ECHANTILLONS 

• Lames de verre

PERFORMANCES

• La vitesse du scan dépend de la résolution choisie. Le scanner utilise un chargeur automatique d'une capacité de 48 lames maximum.

MAINTENANCES 

• Maintenance annuelle par le fournisseur.