GeT : latest news (french)

Introduction au RNA-seq

Wed, 28 Mar 2012 15:49:00 +0200

Retrouvez ici la présentation faite dans le cadre des séminaires LGC.

Maîtriser l’impact de l’ADN génomique contaminant dans la RT-qPCR avec ValidPrime

Wed, 14 Mar 2012 00:00:00 +0100

Henrik Laurell présente sa méthode ValidPrime qui permet de mesurer l’impact de l’ADNg contaminant sur la qPCR.

Séminaires QPCR

Thu, 08 Mar 2012 00:00:00 +0100

Le plateau GeT-TQ organise une série de séminaires-débats autour de la QPCR sur différents sites toulousains.

Quantification des miRNAs par la technologie EXIQON

Thu, 24 Nov 2011 15:50:00 +0100

Bonjour à tous

Suite à la présentation faite par Niels Montano Frandsen de la société EXIQON, le mardi 22 Novembre 2011, la plateforme GeT met à disposition le pdf du séminaire sur la quantification des miRNAs grâce à la technologie EXIQON.

Lien présentation EXIQON

Le Miseq est arrivé!!!

Tue, 15 Nov 2011 09:28:00 +0100

Un an après l'arrivée de l'Hiseq, la Plateforme Génomique accueille le Miseq d'Illumina. Basé sur la même technologie que l'Hiseq, il permet de réaliser 6.8 millions de séquences de 150pb en paired-end (2 x150) soit plus de 1Gb. Il est particulièrement adapté à la validation des librairies Hiseq, le reséquençage, le séquençage de novo de petit génome, les analyses 16S métagénomiques et les smallRNA.

Il sera très prochainement mis à disposition des laboratoires.
Si vous avez des questions n’hésitez pas à nous contacter à genomique(at)toulouse.inra.fr

Quantification des miRNAs par la technologie EXIQON

Mon, 14 Nov 2011 10:19:00 +0100

Bonjour à tous

Le mardi 22 Novembre 2011, la plateforme GeT organise un séminaire sur la quantification des miRNAs grâce à la technologie EXIQON.

La présentation sera faite par Niels Montano Frandsen de la société EXIQON.

Rendez vous donc à 11h à la salle H.Paris, Bat L4, I2MC-UMR 1048, de l'Hopital Rangueil.

Journée Retours HiSeq2000 du 07/10/2011

Tue, 18 Oct 2011 16:37:00 +0200

Plus de 120 personnes se sont retrouvées sur le centre d'Auzeville pour cette journée de partage d'expérience moins d'un an après la mise en service de ce séquenceur nouvelle génération.
Merci à tous les orateurs et aux participants.

Retrouvez une partie des présentations qui ont été faites :

Evolutions de la Plateforme GeT (D. Milan, PF GeT-PlaGe)
Gestion des données HiSeq2000 (G. Salin, GeT PlaGe/C. Klopp Genotoul Bioinfo)
Analyse du développement précoce du fruit chez la tomate par une approche RNAseq (M. Zouine, ENSAT Toulouse)
Identification de « biomarqueurs » de la croissance folliculaire basale chez la brebis (A. Bonnet, INRA Toulouse)Recherche de SNP chez un organisme non séquencé : la caille japonaise 1/2 (F. Pitel/P. Dehais, INRA Toulouse)
Etude de la diversité clonale chez Vitis vinifera (G. Carrier, SupAgro Montpellier)
Cartographie par séquençage d'hybrides irradiés (T. Faraut, INRA Toulouse)
CAPRISNP : détection de SNP chez la chèvre (P. Bardou, INRA Toulouse)

GeT va continuer son développement avec les "Investissements d'avenir"

Thu, 25 Aug 2011 14:55:00 +0200

En octobre dernier, GeT était partie prenante du projet inDiGen déposé aux investissements d’avenir dans le cadre de l’appel Infrastructures nationales, avec 6 autres plateformes IBiSA (Nice, Strasbourg, Montpellier, Pasteur, Montagne Sainte Geneviève, Marseille. Le jury avait apprécié positivement notre dossier, mais avait demandé le regroupement de notre projet avec les projets du CNS et du CNG, ainsi qu’avec la partie NGS du dossier déposé par ReNaBi.

Un petit noyau constitué par Pierre Le Ber (CNS Evry), Jean François Gibrat (INRA Jouy), Pascal Barbry (CNRS Nice), Claudine Médigue (CNS Evry), Jorg Hager (CNG Evry) et Denis Milan (INRA Toulouse) a travaillé au regroupement des projets sous l’autorité de Jean Weissenbach pour aboutir au projet France Génomique.

Le projet va permettre une coordination nationale des plateformes de génomique tournées vers le séquençage de nouvelles générations pour plus de mutualisation et d’efficacité des plateformes. Nous allons ainsi présenter une offre intégrée à la communauté scientifique, apte à prendre en charge des projets de tailles différentes. Un montant global de 60 M€ a été attribué au projet sur 10 ans.

Partage d'expériences séquenceur Illumina HiSeq2000 le 07/10/2011

Fri, 12 Aug 2011 06:12:00 +0200

La plateforme GeT et ses équipes pilotes ont le plaisir de vous convier à une journée de bilan de la validation du séquenceur nouvelle génération Illumina HiSeq 2000.

Le 7 octobre 2011 sur le centre INRA d'Auzeville

Les équipes pilotes présenteront leur projet de recherche et les résultats obtenus. Il y aura également une présentation des perspectives d'évolution de la Plateforme GeT dans les domaines de recherche sur l'humain, la santé, les microorganismes, les animaux et les végétaux.

Vous trouverez ci-joint le programme provisoire. L'inscription à cette journée est gratuite mais obligatoire. Vous trouverez le formulaire d'inscription sur le site GeT.
Merci de diffuser cette information auprès de vos unités.

Nouvel arrivant

Thu, 04 Aug 2011 11:16:00 +0200

Yannick Lippi rejoint l'équipe de GeT-TRiX au 1er août 2011.

Il participera à l'accueil des utilisateurs sur le plateau et l'analyse biostatistique des données.